北京宝杰罗生物公司-首页、菌种鉴定、微生物菌种鉴定、微生物鉴定、微生物新种鉴定、细菌鉴定、真菌鉴定、酵母鉴定、生理生化鉴定(Biolog、API50CH、API20E、API20NE、APIZYM)、16S序列分析、ITS序列分析、26S D1/D2区序列分析、脂肪酸、呼吸醌、极性脂、DNA-DNA杂交、(G+C)mol%、细胞特征性糖、细胞壁DAP、冻干管、MiSeq/PacBio高通量测序菌群分析、全基因组测序、宏基因组、环境微生物菌群分析、微生物产品解析、产品污染菌分析、Agdia植物病害检测试剂、Agdia转基因试纸条、美国ZYMO RESEARCH、watson加长滤芯吸头(1252-207CS、1252-801CS、124-1200S)、冻存管(1392-200-SS、1396-200S)、 三菱MGC厌氧袋、美国MoBio强力土壤微生物DNA提取试剂盒12888-50、eppendorf离心机(5425/5425R、5418/5418R)、8道/单道移液器、排枪、食品安全检测试剂、美国BD培养基、OXOID REMEL培养基、韩国SPL耗材、日本大冢(Otsuka)耗材、美国AXYGEN耗材、美国巴洛克耗材、美国Crystalgen试剂耗材、PCR仪、低温冰箱、摇床、生物安全柜、超净台、灭菌锅、其林贝尔仪器、培养箱、过敏原、致病菌检测试剂 农药兽药残留检测试剂。


  公司电话: 010-6594 5597
 
首 页< 技术服务<动植物基因组分析<SSR分子标记开发

SSR分子标记开发




微卫星DNAMicrostatellite),又称简单重复序列(Simple Sequnce Repeat, SSR),指DNA基因组中1-6个核苷酸的简单重复序列。在各种真核生物基因组中广泛存在,多数以26个碱基为核心单位、串联重复排列的序列。



应用领域:


遗传图谱构建 种质鉴定 遗传多样性分析 基因定位 数量性状基因座(QTL)分析



产品参数:


测序平台及模式

Illumina MiSeq, PE250

样本选择及数据量

1-5 个样,推荐1.0 Gb;

5-10 个样,推荐1.5 Gb;

10-20 个样,推荐2.0 Gb;

备注:不同样本分别提取DNA后等量混合建库

DNA样本量

总量≥1.0 μg,浓度≥20 ng/μl

(总样本)

项目周期

标准分析36天

交付指标

提供不少于100对引物(经过筛选后具有多态性的)

参考基因组

有参、无参均可


 

技术线路:

SSR分子标记开发技术路线.jpg

信息分析内容



序 号

分析项目

类 别

分 析

1

下机数据统计

A

2

数据质控

A

3

高质量数据获取

A

4

SSRs搜索结果及统计

A

5

SSRs模体结果及统计

A

6

SSRs聚类及结果统计

A

7

SSRs多态性评估

A

8

SSRs引物设计

A

A:标准信息分B:高级信息分C:个性化分析




分析结果展示



SSR分子标记开发分析结果.jpg


微生物菌种鉴定分析微生物组分析微生物检测分析 动植物基因组分析转录调控

   真菌全基因组重测序

   细菌全基因重测序

   微生物新种鉴定分析

   微生物菌种多相鉴定分析

   酵母菌快速鉴定分析

   微生物序列分析

   菌群多样性组成谱全长测序

   菌群多样性组成谱测序

   宏基因组测序分析

   宏转录组测序分析

   标记基因全长测序

   扩增子/功能基因测序

   第三代高通量测序平台

   饲料检测与安全评价

   真菌基因组de novo测序

   细菌全基因组完成图测序

   真菌近完成图测序

   环境中活菌群分析

   产品微生物解析

   产品污染菌分析

   动植物基因组全长三代测序

   动植物基因组de novo测序

   SSR分子标记开发

   全基因组关联分析

   群体进化关系

   遗传图谱构建

   BSA性状定位

   全长转录组测序

   全转录组测序

   转录组测序

   Small RNA测序

   SSR/STR/微卫星DNA技术

   扩增片段长度多态性(AFLP)


公司电话:010-6594 5597/6591 9547 传 真:010-6591 9547 E-mail:biogenro88@126.com 京ICP备08004776-2号    京公网安备11010502047288号